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Recientemente hemos informado que el nucleótido de pireno se inserta preferentemente frente a un sitio abásico, el 3'-T de un dímero de timina y la mayoría de las bases no dañadas por la ADN polimerasa eta (pol eta) de levadura.Debido a que el pireno es una molécula no polar sin capacidad de enlace H, las eficiencias inusualmente altas de la inserción de dPMP se atribuyen a su capacidad superior de apilamiento de bases y subrayan la importancia del apilamiento de bases en la selección de nucleótidos por pol eta.Para investigar el papel del enlace H y la geometría del par de bases en la selección de nucleótidos por pol eta, determinamos las eficiencias de inserción de los nucleótidos modificados con base 2,6-diaminopurina, 2-aminopurina, 6-cloropurina e inosina que haga un número diferente de enlaces H con la base de la plantilla dependiendo de la geometría del par de bases.El apareamiento de bases de Watson-Crick parece desempeñar un papel importante en la selección de análogos de nucleótidos para la inserción opuesta a C y T, como lo demuestra la disminución de las eficiencias de inserción relativas con una disminución en el número de enlaces H de Watson-Crick y un aumento en el número de interacciones donante-donante y aceptor-aceptor.La selectividad de la inserción de nucleótidos es mayor frente al 5'-T que al 3'-T del dímero de timina, de acuerdo con trabajos previos que sugieren que el 5'-T se mantiene más rígido que el 3'-T.Además, la inserción de A frente a ambos T del dímero parece estar mediada por el emparejamiento de bases de Watson-Crick y no por el emparejamiento de bases de Hoogsteen basado en las eficiencias de inserción casi idénticas de A y 7-deaza-A, el último de los cuales carece de H- capacidad de unión en N7.Las eficacias relativas para la inserción de nucleótidos que pueden formar pares de bases de Watson-Crick son paralelas a las del fragmento de Klenow, mientras que el fragmento de Klenow discrimina más fuertemente contra los desajustes, de acuerdo con su mayor selectividad de forma.Estos resultados subrayan la importancia del enlace H y la geometría del par de bases de Watson-Crick en la selección de nucleótidos tanto por pol eta como por el fragmento de Klen ow, y el papel menor de la selección de forma en la inserción por pol eta debido a su forma más abierta y menos compleja. sitio activo restringido.