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El principal factor de riesgo para la infección por Clostridium difficile (ICD) es el uso de antibióticos debido a la alteración del equilibrio de la microbiota intestinal del huésped.Para preservar las bacterias probióticas residentes beneficiosas durante el tratamiento de la infección, el uso de moléculas con actividad antibacteriana selectiva mejora la eficacia mediante la eliminación selectiva de C. difficile.Uno de ellos es el alcaloide vegetal 8-hidroxiquinolina (8HQ), que se ha demostrado que inhibe selectivamente los clostridios sin reprimir las bifidobacterias.La actividad antimicrobiana selectiva generalmente se prueba mediante técnicas de cultivo de cepas bacterianas individuales.Sin embargo, la principal limitación de estas técnicas es la incapacidad de describir la dinámica de crecimiento diferencial de más cepas bacterianas en cocultivo dentro del mismo experimento.En el presente estudio, combinamos la hibridación fluorescente in situ y la citometría de flujo para describir los cambios en las células activas y no activas de un cultivo mixto formado por el patógeno oportunista C. difficile CECT 531 y la beneficiosa Bifidobacterium longum subsp.longum CCMDMND BL1 después de la exposición a 8HQ.Se observó que sin 8HQ la proporción de ambas cepas fue casi igual, oscilando entre 22.7 y 77.9 % durante un lapso de tiempo de 12 h, mientras que con 8HQ la proporción de C. difficile activa disminuyó a las 4 h, y persistió solo entre 8.8 y 17,5 %.Por el contrario, el 8HQ no alteró el crecimiento de las bifidobacterias.Los resultados de este estudio mostraron el efecto inhibidor selectivo de 8HQ sobre la dinámica de crecimiento de clostridios y bifidobacterias, y el potencial de este compuesto para el desarrollo de agentes selectivos para el control de CDI.