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El sulfato de condroitina (CS) es una clase de glicosaminoglicanos que se unen covalentemente a las proteínas para formar proteoglicanos.El sulfato de condroitina se distribuye ampliamente en la matriz extracelular y la superficie celular de los tejidos animales.La cadena de azúcar consiste en la polimerización de ácido glucurónico y N-acetilgalactosamina alternados, y está conectada al residuo de serina de la proteína central por una región de enlace similar al azúcar.

Aunque la estructura de la cadena principal del polisacárido no es compleja, es muy heterogénea en cuanto al grado de sulfatación, el grupo sulfato y la distribución de las dos diferencias en ácido iso-urónico en la cadena.La estructura fina del sulfato de condroitina determina su especificidad funcional e interacción con una variedad de moléculas de proteína.