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La estructura 3D predecible del ADN de doble cadena lo hace ideal como plantilla para el diseño ascendente de sitios activos basados ​​en ácidos nucleicos funcionalizados.Aquí exploramos el uso de un dúplex de ADN 14mer como andamio para el posicionamiento preciso y predecible de las funcionalidades catalíticas.Dada la participación ubicua del grupo imidazol basado en histidina en el reconocimiento de proteínas y eventos de catálisis, se investigaron dúplex modificados similares a histidina.La unión de la histamina al C5 de la base de timina a través de un enlace amida permite el posicionamiento flexible de la función imidazol en el surco principal.Las interacciones mutuas entre el imidazol y el dúplex y su influencia en el imidazolio pKaH se investigan colocando una única timina modificada en cuatro posiciones diferentes en el centro de la doble hélice de 14 mer.Usando RMN y dinámica molecular sin restricciones, se establece un motivo estructural que involucra la formación de un enlace de hidrógeno entre el imidazol y el lado Hoogste en de las bases de guanina de dos pares de bases GC vecinos.El motivo contribuye a una estabilización frente a la fusión térmica de 6°C y es clave en la modulación del pKaH del grupo imidazolio.Se describen las características generales, los requisitos previos y el carácter genérico del nuevo motivo regulador de pKaH.