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La enfermedad del hígado graso no alcohólico (NAFLD) tiene un amplio espectro de estados patológicos que van desde la esteatosis leve caracterizada por una retención anormal de lípidos dentro de las células del hígado hasta la esteatohepatitis (NASH) que muestra acumulación de grasa, inflamación, distensión y degradación de los hepatocitos y fibrosis.En última instancia, la esteatohepatitis puede provocar cirrosis hepática y carcinoma hepatocelular. En este estudio, hemos analizado tres cepas de ratones diferentes, A/J, C57BL/6J y PWD/PhJ, que muestran diferentes grados de esteatohepatitis cuando se les administra un 3,5-dietoxicarbonilo. Dieta que contiene -1,4-dihidrocolidina (DDC).Se aplicaron análisis de expresión génica de RNA-Seq, análisis de proteínas y perfiles metabólicos para identificar genes/proteínas expresados ​​diferencialmente y niveles de metabolitos perturbados de muestras de hígado de ratón tras el tratamiento con DDC.El análisis de la vía reveló una alteración del metabolismo del ácido araquidónico (AA) y S-adenosilmetionina (SAMe) en otras vías.Para comprender los cambios metabólicos del metabolismo del ácido araquidónico a la luz de los perfiles de expresión de la enfermedad, se desarrolló y optimizó un modelo cinético de esta vía de acuerdo con los niveles de metabolitos.Posteriormente, el modelo se utilizó para estudiar los efectos in silico de posibles objetivos farmacológicos para la esteatohepatitis. Identificamos el metabolismo de AA/eicosanoides como altamente perturbado en ratones inducidos por DDC mediante una combinación de un enfoque experimental e in silico.Nuestro análisis de la ruta metabólica de AA/eicosanoides sugiere que el ácido 5-hidroxieicosatetraenoico (5-HETE), el ácido 15-hidroxieicosatetraenoico (15-HETE) y la prostaglandina D2 (PGD2) están perturbados en ratones DDC.Además demostramos que un modelo dinámico se puede utilizar para la predicción cualitativa de cambios metabólicos basados ​​en datos transcriptómicos en un contexto relacionado con la enfermedad.Además, se identificó que el metabolismo de SAMe estaba perturbado debido al tratamiento con DDC.Varios genes así como algunos metabolitos de este módulo muestran diferencias entre A/J y C57BL/6J por un lado y PWD/PhJ por el otro.